Rongga mulut dilapisi oleh epitel skuamosa bertingkat (stratified squamous epithelium) yang dapat berkeratin (keratinized), sebagian berkeratin (parakeratinized), atau tidak berkeratin (nonkeratinized). Epitel skuamosa keratinized terdiri dari empat lapisan, yaitu stratum basale (lapisan basal), stratum spinosum (lapisan berduri), stratum granulosum (lapisan granular), dan stratum korneum (lapisan berkeratin). Pada epitel nonkeratinized, dua lapisan dalam (basal dan spinosum) tetap sama, tetapi lapisan luarnya disebut sebagai lapisan superfisial dan intermediet. Berdasarkan fungsi, mukosa oral dibagi menjadi: