Pigmentasi Endogen membahas berbagai kondisi pigmentasi oral dan perioral yang berasal dari dalam tubuh, utamanya melanin. Materi ini mencakup pigmentasi fokal seperti freckles, makula melanotik, nevus pigmentosus, hingga melanoma maligna yang memerlukan intervensi serius. Selain itu, dibahas pula pigmentasi multifokal seperti pigmentasi fisiologis, drug induced melanosis, smokers melanosis, post inflammatory hyperpigmentation, dan melasma, lengkap dengan gambaran klinis, etiologi, serta penanganannya.