Fisiologi embriologi membahas secara komprehensif perkembangan organisme mulai dari satu sel tunggal menjadi individu multiseluler yang kompleks dengan berbagai sistem organ yang berfungsi. Materi ini mencakup proses krusial seperti fertilisasi, di mana sperma dan sel telur bersatu membentuk zigot, yang kemudian mengalami segmentasi dan gastrulasi untuk membentuk lapisan-lapisan sel dasar. Selanjutnya, dibahas organogenesis, yaitu periode pembentukan organ utama dari minggu ketiga hingga kedelapan, di mana disfungsi dapat menyebabkan anomali kongenital. Penting juga untuk memahami periode kritis, fase rentan di mana perkembangan janin sangat peka terhadap pengaruh eksternal seperti zat kimia, radiasi, atau infeksi. Materi ini juga menjelaskan peran vital plasenta sebagai organ endokrin, imun, dan fisiologis yang mendukung sirkulasi serta perkembangan janin secara keseluruhan.