Antibiotik lokal diterapkan secara langsung pada area yang terkena infeksi dalam perawatan periodontal, seperti pada kantong gusi, untuk mengendalikan pertumbuhan bakteri. Sementara itu, antibiotik sistemik diberikan melalui mulut atau injeksi untuk menangani infeksi secara menyeluruh di seluruh tubuh, sering digunakan dalam kasus-kasus periodontitis yang lebih parah atau sistemik.